MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio sp. EJY3 chromosome 2

Total Repeats: 36768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016614	ACA	2	6	75	80	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016614	A	6	6	80	85	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016614	ATTC	2	8	104	111	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016614	T	6	6	154	159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016614	GAT	2	6	177	182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016614	ATC	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016614	AAAC	2	8	398	405	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016614	ATCATG	2	12	450	461	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016614	TGA	2	6	512	517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016614	CCG	2	6	542	547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_016614	ATC	2	6	584	589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016614	AGG	2	6	602	607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016614	TTG	2	6	634	639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016614	ATC	2	6	686	691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016614	ATC	2	6	709	714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016614	TTG	2	6	771	776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016614	ATC	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016614	AAC	3	9	839	847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016614	A	6	6	924	929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016614	T	6	6	935	940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016614	TTTA	2	8	942	949	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016614	TTC	2	6	967	972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016614	ATG	2	6	1015	1020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375262320
24	NC_016614	TGA	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375262320
25	NC_016614	A	6	6	1028	1033	100 %	0 %	0 %	0 %	375262320
26	NC_016614	AAG	2	6	1050	1055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375262320
27	NC_016614	TCT	2	6	1090	1095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375262320
28	NC_016614	CAG	2	6	1182	1187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375262320
29	NC_016614	ACT	2	6	1207	1212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375262320
30	NC_016614	TGC	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375262320
31	NC_016614	ACA	2	6	1257	1262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375262320
32	NC_016614	AGC	2	6	1272	1277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375262320
33	NC_016614	TTTA	2	8	1290	1297	25 %	75 %	0 %	0 %	375262320
34	NC_016614	GAA	2	6	1318	1323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375262320
35	NC_016614	AAAAAC	2	12	1427	1438	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	375262320
36	NC_016614	AAAC	2	8	1467	1474	75 %	0 %	0 %	25 %	375262320
37	NC_016614	CGC	2	6	1502	1507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375262320
38	NC_016614	CGA	2	6	1508	1513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375262320
39	NC_016614	TCG	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375262320
40	NC_016614	TC	3	6	1541	1546	0 %	50 %	0 %	50 %	375262320
41	NC_016614	ATT	2	6	1564	1569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375262320
42	NC_016614	CCA	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375262320
43	NC_016614	A	6	6	1665	1670	100 %	0 %	0 %	0 %	375262320
44	NC_016614	GAT	2	6	1684	1689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375262320
45	NC_016614	TGA	2	6	1691	1696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375262320
46	NC_016614	ATC	2	6	1736	1741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375262320
47	NC_016614	TGC	2	6	1764	1769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375262320
48	NC_016614	AGA	2	6	1992	1997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375262320
49	NC_016614	CGT	2	6	2066	2071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375262320
50	NC_016614	CTT	2	6	2100	2105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375262320
51	NC_016614	ACA	2	6	2130	2135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375262320
52	NC_016614	TCG	2	6	2181	2186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375262320
53	NC_016614	TGT	2	6	2319	2324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375262320
54	NC_016614	ACC	2	6	2339	2344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375262320
55	NC_016614	ACA	2	6	2514	2519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375262320
56	NC_016614	AGA	2	6	2523	2528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375262320
57	NC_016614	CAT	2	6	2538	2543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375262320
58	NC_016614	GCA	2	6	2696	2701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375262320
59	NC_016614	TCG	2	6	2904	2909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375262320
60	NC_016614	ATG	2	6	2930	2935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375262320
61	NC_016614	TGA	2	6	2967	2972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375262320
62	NC_016614	CAT	2	6	2986	2991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016614	TGAT	2	8	3025	3032	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016614	AT	4	8	3044	3051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016614	ATA	2	6	3056	3061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016614	TGA	2	6	3152	3157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016614	ATAG	2	8	3161	3168	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016614	AT	3	6	3173	3178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016614	CATT	2	8	3184	3191	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016614	T	8	8	3230	3237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016614	ATC	2	6	3262	3267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375262321
72	NC_016614	TTG	3	9	3365	3373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375262321
73	NC_016614	CACT	2	8	3375	3382	25 %	25 %	0 %	50 %	375262321
74	NC_016614	CTG	2	6	3392	3397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375262321
75	NC_016614	TGC	2	6	3429	3434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375262321
76	NC_016614	AAC	2	6	3574	3579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375262321
77	NC_016614	CAA	2	6	3588	3593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375262321
78	NC_016614	TCGC	2	8	3611	3618	0 %	25 %	25 %	50 %	375262321
79	NC_016614	GATCT	2	10	3713	3722	20 %	40 %	20 %	20 %	375262321
80	NC_016614	TCG	2	6	3797	3802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375262322
81	NC_016614	ATG	2	6	3806	3811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375262322
82	NC_016614	CAG	2	6	3900	3905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375262322
83	NC_016614	TGC	2	6	3929	3934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375262322
84	NC_016614	TGAG	2	8	3949	3956	25 %	25 %	50 %	0 %	375262322
85	NC_016614	TCT	2	6	4001	4006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375262322
86	NC_016614	TA	3	6	4039	4044	50 %	50 %	0 %	0 %	375262322
87	NC_016614	CCA	2	6	4199	4204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375262322
88	NC_016614	CCA	2	6	4248	4253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375262322
89	NC_016614	TGAG	2	8	4359	4366	25 %	25 %	50 %	0 %	375262322
90	NC_016614	GC	3	6	4501	4506	0 %	0 %	50 %	50 %	375262322
91	NC_016614	TCT	2	6	4601	4606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375262322
92	NC_016614	CCG	3	9	4616	4624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375262322
93	NC_016614	ATA	2	6	4658	4663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375262322
94	NC_016614	GTT	2	6	4697	4702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375262323
95	NC_016614	CGT	2	6	4709	4714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375262323
96	NC_016614	AAG	2	6	4727	4732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375262323
97	NC_016614	GAT	2	6	4763	4768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375262323
98	NC_016614	ATG	2	6	4816	4821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375262323
99	NC_016614	TGC	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375262323
100	NC_016614	GCC	2	6	5292	5297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375262323
101	NC_016614	AATG	2	8	5301	5308	50 %	25 %	25 %	0 %	375262323
102	NC_016614	AC	3	6	5458	5463	50 %	0 %	0 %	50 %	375262323
103	NC_016614	CT	3	6	5466	5471	0 %	50 %	0 %	50 %	375262323
104	NC_016614	ATT	2	6	5553	5558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016614	ATG	2	6	5761	5766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016614	GT	3	6	5871	5876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016614	GGA	2	6	5879	5884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016614	GAA	2	6	5912	5917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375262324
109	NC_016614	GAA	3	9	5951	5959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375262324
110	NC_016614	AGA	2	6	6002	6007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375262324
111	NC_016614	GAA	2	6	6053	6058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375262324
112	NC_016614	TCA	2	6	6096	6101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016614	ACAA	2	8	6102	6109	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016614	CG	3	6	6314	6319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016614	TCG	2	6	6336	6341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016614	GCC	2	6	6501	6506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375262325
117	NC_016614	TGA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375262325
118	NC_016614	A	7	7	6512	6518	100 %	0 %	0 %	0 %	375262325
119	NC_016614	AAGC	2	8	6535	6542	50 %	0 %	25 %	25 %	375262325
120	NC_016614	TTTGG	2	10	6549	6558	0 %	60 %	40 %	0 %	375262325
121	NC_016614	AG	3	6	6565	6570	50 %	0 %	50 %	0 %	375262325
122	NC_016614	AGA	2	6	6594	6599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375262325
123	NC_016614	TGA	2	6	6624	6629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375262325
124	NC_016614	CAG	2	6	6747	6752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016614	AG	3	6	6811	6816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016614	GAA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375262326
127	NC_016614	TG	3	6	6920	6925	0 %	50 %	50 %	0 %	375262326
128	NC_016614	A	6	6	6988	6993	100 %	0 %	0 %	0 %	375262326
129	NC_016614	GTGGCG	2	12	7040	7051	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	375262326
130	NC_016614	GAT	3	9	7249	7257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375262326
131	NC_016614	ATG	2	6	7279	7284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375262326
132	NC_016614	AGA	2	6	7314	7319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375262326
133	NC_016614	TTC	2	6	7354	7359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375262326
134	NC_016614	GAA	2	6	7411	7416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375262326
135	NC_016614	CTCAAA	2	12	7430	7441	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	375262326
136	NC_016614	CTT	2	6	7489	7494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375262326
137	NC_016614	TGA	2	6	7503	7508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375262326
138	NC_016614	CAG	2	6	7513	7518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375262326
139	NC_016614	TTCG	2	8	7543	7550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016614	CTTC	2	8	7568	7575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016614	T	6	6	7584	7589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016614	ATCAA	2	10	7731	7740	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_016614	TAA	2	6	7744	7749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016614	ATG	2	6	7762	7767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375262327
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146	NC_016614	AGT	2	6	7837	7842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375262327
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153	NC_016614	ACA	2	6	8384	8389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375262327
154	NC_016614	TCAA	2	8	8450	8457	50 %	25 %	0 %	25 %	375262328
155	NC_016614	GA	3	6	8531	8536	50 %	0 %	50 %	0 %	375262328
156	NC_016614	TGG	2	6	8537	8542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375262328
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165	NC_016614	TGG	2	6	9077	9082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375262328
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169	NC_016614	CG	4	8	9290	9297	0 %	0 %	50 %	50 %	375262329
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267	NC_016614	CATT	2	8	14027	14034	25 %	50 %	0 %	25 %	375262333
268	NC_016614	AGA	2	6	14069	14074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375262333
269	NC_016614	AGGGG	2	10	14107	14116	20 %	0 %	80 %	0 %	375262333
270	NC_016614	ATA	2	6	14462	14467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375262334
271	NC_016614	TCA	2	6	14486	14491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375262334
272	NC_016614	TGCGA	2	10	14521	14530	20 %	20 %	40 %	20 %	375262334
273	NC_016614	ACA	2	6	14534	14539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375262334
274	NC_016614	CGG	2	6	14547	14552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375262334
275	NC_016614	T	6	6	14699	14704	0 %	100 %	0 %	0 %	375262334
276	NC_016614	GGGT	2	8	14739	14746	0 %	25 %	75 %	0 %	375262334
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278	NC_016614	GTG	2	6	14945	14950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
279	NC_016614	GGCA	2	8	14956	14963	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
280	NC_016614	TAT	2	6	14990	14995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375262335
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282	NC_016614	TA	3	6	15073	15078	50 %	50 %	0 %	0 %	375262335
283	NC_016614	CCA	2	6	15141	15146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375262335
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285	NC_016614	GTC	2	6	15196	15201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375262335
286	NC_016614	GGC	2	6	15229	15234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375262335
287	NC_016614	CGA	2	6	15276	15281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375262335
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289	NC_016614	GCT	2	6	15380	15385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_016614	CTG	2	6	15396	15401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_016614	ATG	2	6	15495	15500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_016614	TGT	2	6	15601	15606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_016614	AGTA	2	8	15656	15663	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
294	NC_016614	ACT	2	6	15665	15670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_016614	GGA	2	6	15815	15820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_016614	ATA	2	6	15856	15861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375262336
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299	NC_016614	TCT	2	6	15981	15986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375262336
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301	NC_016614	T	7	7	16072	16078	0 %	100 %	0 %	0 %	375262336
302	NC_016614	TGA	2	6	16112	16117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375262336
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313	NC_016614	TGG	2	6	16893	16898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375262336
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317	NC_016614	T	6	6	17121	17126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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322	NC_016614	CAAA	2	8	17336	17343	75 %	0 %	0 %	25 %	375262337
323	NC_016614	CAGCG	2	10	17356	17365	20 %	0 %	40 %	40 %	375262337
324	NC_016614	ATAA	2	8	17377	17384	75 %	25 %	0 %	0 %	375262337
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379	NC_016614	A	6	6	20281	20286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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381	NC_016614	GGT	2	6	20477	20482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375262341
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394	NC_016614	CAG	2	6	21050	21055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375262341
395	NC_016614	TG	3	6	21086	21091	0 %	50 %	50 %	0 %	375262341
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398	NC_016614	GTT	3	9	21257	21265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
399	NC_016614	CAA	2	6	21271	21276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
400	NC_016614	T	6	6	21316	21321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_016614	CTT	2	6	21323	21328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_016614	GT	3	6	21500	21505	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
403	NC_016614	TAT	2	6	21552	21557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375262342
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408	NC_016614	CTAT	2	8	21901	21908	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
409	NC_016614	TTAA	2	8	21925	21932	50 %	50 %	0 %	0 %	375262343
410	NC_016614	CT	3	6	21948	21953	0 %	50 %	0 %	50 %	375262343
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433	NC_016614	T	6	6	23383	23388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_016614	T	6	6	24755	24760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_016614	TTA	2	6	24776	24781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_016614	GTTT	2	8	24796	24803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
463	NC_016614	A	6	6	24810	24815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_016614	T	7	7	24841	24847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_016614	AG	3	6	24852	24857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
466	NC_016614	G	6	6	24857	24862	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
467	NC_016614	A	7	7	24897	24903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_016614	GTA	2	6	25046	25051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375262347
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495	NC_016614	A	6	6	26645	26650	100 %	0 %	0 %	0 %	375262348
496	NC_016614	TC	3	6	26670	26675	0 %	50 %	0 %	50 %	375262348
497	NC_016614	AATC	2	8	26727	26734	50 %	25 %	0 %	25 %	375262348
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